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El análisis exploratorio multi-ómico sugiere respuestas inmunitarias dependientes del contexto a la suplementación con vitamina D(3) en PBMCs de pacientes con esclerosis múltiple

Título original: Exploratory multi-omics analysis suggests context-dependent immune responses to vitamin D(3) supplementation in PBMCs of multiple sclerosis patients

Frontiers in immunology · Tripathi T, Gospodarska E, Geran R, Sperber PS, Schmitz-Hübsch T, Paul F · 1 de enero de 2026

Resumen del estudio (inglés)

INTRODUCTION: Vitamin D deficiency is a recognized risk factor for multiple sclerosis (MS), yet the in vivo molecular mechanisms linking vitamin D3 supplementation to immune regulation remain incompletely understood. METHODS: We performed longitudinal RNA sequencing (RNA-seq) and assay for transposase-accessible chromatin using sequencing (ATAC-seq) profiling of peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from patients with relapsing-remitting MS who either initiated daily high-dose vitamin D3 supplementation or continued regular supplementation, alongside healthy individuals receiving monthly vitamin D3 bolus supplementation. Within-individual changes over the follow-up period were assessed and integrated with published THP-1-derived vitamin D receptor (VDR) binding datasets and previously validated vitamin D target genes. RESULTS: PBMCs from MS patients retained stable cohort-associated transcriptional and chromatin accessibility signatures that remained distinct from those of the healthy cohort. Vitamin D3 supplementation was not associated with global transcriptomic remodeling but was associated with changes in selected immune-regulatory gene expression programs. In the daily high-dose MS group, candidate genes showing longitudinal expression changes were enriched for innate immune sensing, Toll-like receptor signaling, cytokine-mediated communication, interferon-associated responses, and immune-cell differentiation. Candidate gene sets showed limited overlap across cohorts, although a subset of immune-regulatory and established vitamin D target genes was reproducibly identified. Chromatin accessibility profiling revealed thousands of cohort-specific differentially accessible regions, whereas supplementation-associated accessibility changes were comparatively modest. Integrative analysis prioritized a small set of candidate genes supported by multiple independent datasets, including AZI2, ABCA2, and SIGLEC6. DISCUSSION: The findings suggest selective, context-dependent candidate molecular responses to vitamin D3 supplementation rather than global immune reprogramming. They also demonstrate the value of integrating transcriptomic and chromatin accessibility data to prioritize vitamin D-responsive pathways and genes for mechanistic validation in larger prospective and randomized studies. Copyright © 2026 Tripathi, Gospodarska, Geran, Sperber, Schmitz-Hübsch, Paul and Carlberg. DOI: 10.3389/fimmu.2026.1845005 PMCID: PMC13472867

Traducción al español (IA · NME)

INTRODUCCIÓN: La deficiencia de vitamina D es un factor de riesgo reconocido para la esclerosis múltiple (EM), sin embargo, los mecanismos moleculares in vivo que vinculan la suplementación de vitamina D3 con la regulación inmunitaria aún no se comprenden completamente. MÉTODOS: Realizamos secuenciación de ARN longitudinal (RNA-seq) y perfilado de accesibilidad de cromatina mediante ensayo de transposasa accesible a la cromatina utilizando secuenciación (ATAC-seq) de células mononucleares de sangre periférica (PBMCs) de pacientes con EM remitente-recurrente que iniciaron suplementación diaria de alta dosis de vitamina D3 o continuaron con suplementación regular, junto con individuos sanos que recibieron suplementación mensual de vitamina D3 en bolos. Se evaluaron los cambios dentro de cada individuo durante el período de seguimiento y se integraron con conjuntos de datos publicados de unión del receptor de vitamina D (VDR) derivados de THP-1 y genes diana de vitamina D previamente validados. RESULTADOS: Las PBMCs de pacientes con EM mantuvieron firmas estables de transcripción y accesibilidad de cromatina asociadas al cohorte que permanecieron distintas de las del cohorte sano. La suplementación de vitamina D3 no se asoció con una remodelación transcriptómica global, pero sí con cambios en programas seleccionados de expresión génica reguladora del sistema inmunitario. En el grupo de EM con alta dosis diaria, los genes candidatos que mostraron cambios de expresión longitudinal se enriquecieron para la detección inmune innata, la señalización del receptor tipo Toll, la comunicación mediada por citoquinas, las respuestas asociadas a interferones y la diferenciación de células inmunitarias. Los conjuntos de genes candidatos mostraron una superposición limitada entre cohortes, aunque se identificó de manera reproducible un subconjunto de genes reguladores del sistema inmunitario y genes diana establecidos de vitamina D. El perfilado de accesibilidad de cromatina reveló miles de regiones diferencialmente accesibles específicas de cohorte, mientras que los cambios de accesibilidad asociados a la suplementación fueron comparativamente modestos. El análisis integrativo priorizó un pequeño conjunto de genes candidatos respaldados por múltiples conjuntos de datos independientes, incluidos AZI2, ABCA2 y SIGLEC6. DISCUSIÓN: Los hallazgos sugieren respuestas moleculares candidatas selectivas y dependientes del contexto a la suplementación de vitamina D3 en lugar de una reprogramación inmune global. También demuestran el valor de integrar datos transcriptómicos y de accesibilidad de cromatina para priorizar vías y genes sensibles a la vitamina D para su validación mecanicista en estudios prospectivos y aleatorizados más amplios. Copyright © 2026 Tripathi, Gospodarska, Geran, Sperber, Schmitz-Hübsch, Paul y Carlberg. DOI: 10.3389/fimmu.2026.1845005 PMCID: PMC13472867

Traducción automática para apoyo de lectura. Para uso clínico recomendamos consultar el texto original publicado.

Detalles bibliográficos

  • Autores: Tripathi T, Gospodarska E, Geran R, Sperber PS, Schmitz-Hübsch T, Paul F
  • Publicado en: Frontiers in immunology
  • PMID: 42601952
  • DOI: 10.3389/fimmu.2026.1845005

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